More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0435 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.41 
 
 		 639 aa  822    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.2 
 
 		 642 aa  872    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  100 
 
 		 639 aa  1296    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.5 
 
 		 640 aa  785    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  64.07 
 
 		 643 aa  881    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  64.91 
 
 		 644 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.17 
 
 		 647 aa  343  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34 
 
 		 647 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  32.66 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  32.61 
 
 		 645 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  31.51 
 
 		 648 aa  302  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  40.55 
 
 		 811 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  40.77 
 
 		 519 aa  154  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  38.99 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  37.2 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  39.07 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  39.44 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  39.44 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  40.28 
 
 		 523 aa  140  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  33.55 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  39.44 
 
 		 482 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  38.37 
 
 		 551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  39 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  36.16 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  37.6 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  27.43 
 
 		 503 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  28.38 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  37.93 
 
 		 139 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  27.39 
 
 		 500 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  27.47 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  26.14 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  27.38 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.85 
 
 		 139 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.16 
 
 		 148 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.22 
 
 		 130 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  39.44 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  42.25 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.66 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45 
 
 		 63 aa  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  38.03 
 
 		 182 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  40.85 
 
 		 181 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  35.25 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  35.25 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.94 
 
 		 488 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  24.6 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  24.06 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.03 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36.62 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  32.89 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.51 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  26.46 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.62 
 
 		 181 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  24.57 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  22.22 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 		 233 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.08 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  29.81 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  24.63 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.67 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.99 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.01 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  25.11 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0520  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  51.11 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.701986  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  28.99 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.26 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.67 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  36.62 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  27.43 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  30.06 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.53 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  30.86 
 
 		 472 aa  57  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0512  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  48.89 
 
 		 187 aa  57  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00341005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  37.35 
 
 		 172 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.67 
 
 		 130 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 609 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.95 
 
 		 151 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2300  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  47.92 
 
 		 148 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63514  normal  0.746054 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  40.85 
 
 		 591 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 		 167 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 		 193 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.62 
 
 		 166 aa  55.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  33.75 
 
 		 396 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40 
 
 		 220 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  27.34 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  40.48 
 
 		 131 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.37 
 
 		 175 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  28.3 
 
 		 484 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  26.89 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.51 
 
 		 438 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.48 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  22.08 
 
 		 455 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  32.63 
 
 		 131 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  25.55 
 
 		 479 aa  54.7  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 		 185 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 531 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 128 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>