More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2187 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 531 aa  1103    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  46.53 
 
 		 507 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  35.43 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.43 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  35.01 
 
 		 508 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  34.8 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.01 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.01 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.8 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  34.8 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  34.8 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 521 aa  300  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 513 aa  300  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 510 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  34 
 
 		 521 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  33.19 
 
 		 508 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 526 aa  292  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  32.4 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.48 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  33.05 
 
 		 525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 		 520 aa  282  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.97 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 499 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  31.81 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3916  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 508 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 512 aa  253  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 513 aa  252  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 592 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 506 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.21 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 518 aa  193  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1335  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.79 
 
 		 227 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4286  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0906623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2687  hypothetical protein  31.05 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000272458  normal  0.186657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1745  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.637399  normal  0.516042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  27.94 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  27.68 
 
 		 439 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  26.72 
 
 		 439 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3537  oxidoreductase  24.8 
 
 		 427 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.314766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1670  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 411 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  24.04 
 
 		 428 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0863  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 430 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  25.12 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 428 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 428 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 431 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 442 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  25.19 
 
 		 449 aa  90.5  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 427 aa  90.1  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10493  hypothetical protein  27.68 
 
 		 289 aa  90.1  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000931563  normal  0.209074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 424 aa  90.1  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  24.44 
 
 		 424 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 478 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 465 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  25.27 
 
 		 431 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  23.78 
 
 		 426 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 426 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 441 aa  87.8  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 433 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  23.78 
 
 		 426 aa  87  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>