241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3090 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  100 
 
 		 520 aa  1020    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  64.1 
 
 		 546 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  59.72 
 
 		 523 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  57.06 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  57.38 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  56.66 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  56.66 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  57.58 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  58.3 
 
 		 482 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  58.77 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  51.08 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  45.95 
 
 		 811 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  42.92 
 
 		 508 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  43.38 
 
 		 508 aa  299  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.26 
 
 		 647 aa  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  31.72 
 
 		 647 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  31.43 
 
 		 647 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.9 
 
 		 643 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  34.76 
 
 		 648 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  33.73 
 
 		 639 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.45 
 
 		 642 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38 
 
 		 639 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  33.33 
 
 		 645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.68 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.41 
 
 		 644 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.05 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  26.73 
 
 		 520 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.88 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.95 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  24.84 
 
 		 455 aa  91.3  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  23.65 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  24.63 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.96 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  25.11 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  27.07 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  24.02 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  28.11 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  26.62 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  26.37 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  22.92 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.95 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  21.58 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  25.66 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  27.18 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  27.77 
 
 		 543 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  26.82 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  27.06 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.16 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  27.48 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.7 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.7 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  24.44 
 
 		 591 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  26.16 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  22.09 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  28.05 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  26.69 
 
 		 624 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  23 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  23.93 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25.35 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.5 
 
 		 465 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  23.41 
 
 		 481 aa  67  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.01 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  26.74 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.45 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.28 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.71 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.57 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  26.43 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  24.7 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.14 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.29 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  22.72 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  23.21 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.55 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.4 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  23.9 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  27.6 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  23.98 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  22.32 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  23.05 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.02 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.52 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.38 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  50.82 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.48 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  25.05 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  65.79 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.08 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  51.16 
 
 		 542 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  42.62 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  24.44 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.96 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  41.11 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.14 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.27 
 
 		 592 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0355  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.78 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  34.69 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>