259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0335 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  78.29 
 
 		 478 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  76.64 
 
 		 486 aa  812    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  65.2 
 
 		 479 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 488 aa  1010    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  91.6 
 
 		 488 aa  932    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  66.74 
 
 		 490 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  69.88 
 
 		 499 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  72.12 
 
 		 481 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  66.25 
 
 		 482 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  66.74 
 
 		 490 aa  673    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  64.99 
 
 		 483 aa  653    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  64.95 
 
 		 489 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  69.73 
 
 		 484 aa  737    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  71.57 
 
 		 484 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  76.64 
 
 		 486 aa  811    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  84.49 
 
 		 490 aa  853    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  64.78 
 
 		 479 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  70.35 
 
 		 484 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  54.13 
 
 		 591 aa  525  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  34.44 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  33.2 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  33.89 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  35.76 
 
 		 475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  32.85 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  35.76 
 
 		 475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  33.26 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  34.21 
 
 		 472 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  32.02 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  35.27 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  35.29 
 
 		 589 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.88 
 
 		 479 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  34.43 
 
 		 479 aa  261  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.02 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  32.93 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  33 
 
 		 466 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  34.02 
 
 		 465 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  32.8 
 
 		 466 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  33.07 
 
 		 472 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.4 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.85 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.2 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  33.13 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  31.17 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.99 
 
 		 599 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  33.19 
 
 		 460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  33 
 
 		 624 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  31.97 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.28 
 
 		 461 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  31.68 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.1 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  31.53 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  31.7 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  31.3 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  24.03 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.69 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25 
 
 		 503 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  23.65 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.72 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  23.9 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.85 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.41 
 
 		 438 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.31 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.31 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.31 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.58 
 
 		 811 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  22.18 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.44 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.44 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.22 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.04 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.91 
 
 		 989 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.74 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  25.1 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.62 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.24 
 
 		 647 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.18 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  24.3 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  27.78 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  23.66 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  25.67 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.06 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  23.81 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  23.01 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  23.46 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  26.16 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  26.62 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  25.94 
 
 		 639 aa  62  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  23.21 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  28.88 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  35.16 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  22.92 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  24.13 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  42.03 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  24.49 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  24.28 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>