187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2537 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
175 aa  353  7.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 
135 aa  96.3  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.54 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  45.83 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.46 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  34.18 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  35.29 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.89 
 
 
435 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  45.31 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
642 aa  62  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  33.33 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.68 
 
 
644 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  40 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
640 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.47 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30.66 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  34.48 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 
139 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30.34 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  43.75 
 
 
220 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.78 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.03 
 
 
233 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.14 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.24 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  45.45 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.63 
 
 
643 aa  54.7  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
381 aa  54.3  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  45.61 
 
 
365 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  36.96 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.31 
 
 
206 aa  54.3  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.56 
 
 
370 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.85 
 
 
399 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.62 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.56 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  26.32 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  39.34 
 
 
63 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
364 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 
239 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  32.17 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.64 
 
 
372 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.27 
 
 
300 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.42 
 
 
639 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  26.16 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.53 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44 
 
 
239 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  44.64 
 
 
345 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.64 
 
 
349 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  42.86 
 
 
369 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  28.28 
 
 
114 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
338 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  31.86 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.3 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
361 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.86 
 
 
349 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.07 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.74 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
360 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.34 
 
 
330 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
361 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 
315 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.12 
 
 
204 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  41.07 
 
 
346 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.66 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  38.89 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.43 
 
 
359 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.18 
 
 
179 aa  47.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.64 
 
 
441 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  33.33 
 
 
647 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  37.5 
 
 
504 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  40.32 
 
 
440 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 
159 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  32.86 
 
 
354 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.29 
 
 
220 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.36 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.55 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.33 
 
 
647 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  36.36 
 
 
392 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
355 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.1 
 
 
374 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
201 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.47 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.47 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.47 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.96 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
368 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
343 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.68 
 
 
370 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>