121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0962 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  668    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.77 
 
 
356 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.77 
 
 
356 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  44.87 
 
 
346 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.11 
 
 
368 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.65 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.48 
 
 
338 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.83 
 
 
359 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  44.81 
 
 
440 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  43.03 
 
 
345 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
349 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  42.86 
 
 
358 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.23 
 
 
360 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  46.3 
 
 
369 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.19 
 
 
349 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.35 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.68 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.77 
 
 
372 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  43.21 
 
 
354 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.42 
 
 
300 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.12 
 
 
355 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.14 
 
 
364 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.54 
 
 
374 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.25 
 
 
365 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  44.83 
 
 
315 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.07 
 
 
361 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 
361 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.79 
 
 
370 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.52 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  38.81 
 
 
392 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.08 
 
 
399 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  33.53 
 
 
414 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.53 
 
 
414 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.53 
 
 
414 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.97 
 
 
402 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
406 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  30.92 
 
 
429 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.22 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.81 
 
 
199 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.93 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.95 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.57 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.46 
 
 
214 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  35.04 
 
 
192 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.51 
 
 
141 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  35.94 
 
 
207 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  36.62 
 
 
205 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  32.99 
 
 
168 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  35.14 
 
 
203 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  40.58 
 
 
163 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  39.44 
 
 
168 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  45.61 
 
 
159 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  45.76 
 
 
149 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
199 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1208  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.75 
 
 
177 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  36.23 
 
 
165 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
435 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.43 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.68 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.09 
 
 
122 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 
175 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  39.19 
 
 
173 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.34 
 
 
175 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 
141 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  30.21 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.98 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  43.86 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  39.19 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
161 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
134 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.64 
 
 
136 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.54 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.91 
 
 
324 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  43.86 
 
 
139 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.19 
 
 
269 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.38 
 
 
130 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.27 
 
 
166 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.86 
 
 
175 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  41.82 
 
 
160 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 
639 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
159 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.65 
 
 
272 aa  46.2  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.6 
 
 
159 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  32.14 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
63 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 
139 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.89 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.21 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4204  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.38 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.62 
 
 
171 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1384  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3226  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.68 
 
 
180 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>