241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1640 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  87.92 
 
 
207 aa  320  8e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.1 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.64 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.91 
 
 
161 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  57.3 
 
 
151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.25 
 
 
122 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.98 
 
 
192 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.61 
 
 
146 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.48 
 
 
128 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  48.36 
 
 
124 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.36 
 
 
124 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.36 
 
 
124 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.82 
 
 
138 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.9 
 
 
141 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  50.45 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
134 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  45.1 
 
 
152 aa  95.5  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  45.74 
 
 
142 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  47.37 
 
 
141 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.74 
 
 
163 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  49.44 
 
 
160 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.14 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.13 
 
 
179 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.06 
 
 
151 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.24 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.02 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
171 aa  72  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  39.39 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  39.58 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  50.91 
 
 
647 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
526 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
135 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.5 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 
508 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.74 
 
 
182 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  40 
 
 
504 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.79 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  35.87 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  34.38 
 
 
139 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
136 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  46.77 
 
 
206 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.78 
 
 
182 aa  58.2  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.11 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.63 
 
 
148 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
513 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.43 
 
 
435 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  41.18 
 
 
102 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.3 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.05 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  51.02 
 
 
647 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  51.02 
 
 
647 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.83 
 
 
141 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  45.31 
 
 
216 aa  55.1  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  44.44 
 
 
179 aa  54.7  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  34.38 
 
 
131 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 
172 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.98 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 
516 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.78 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 
507 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.26 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  55.32 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.07 
 
 
180 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  55.32 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 
508 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
592 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  39.66 
 
 
645 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.37 
 
 
508 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  38.1 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  38.1 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.1 
 
 
508 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.37 
 
 
508 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.54 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 
227 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  41.77 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
508 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  42.86 
 
 
179 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  38.1 
 
 
508 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  38.1 
 
 
508 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.48 
 
 
185 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
130 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  46.81 
 
 
648 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45 
 
 
63 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.92 
 
 
139 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  36.9 
 
 
508 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
139 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  29.75 
 
 
369 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  36.9 
 
 
508 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 
521 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
513 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  55.1 
 
 
349 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
644 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>