185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3110 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  324  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  79.52 
 
 
160 aa  236  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  61.8 
 
 
151 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.12 
 
 
122 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.99 
 
 
207 aa  121  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.34 
 
 
204 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.43 
 
 
161 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.72 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  46.15 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.81 
 
 
138 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  44.03 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.07 
 
 
146 aa  91.3  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  46.81 
 
 
141 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.76 
 
 
141 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.84 
 
 
192 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.56 
 
 
128 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.77 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.5 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.73 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.22 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.08 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.94 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.83 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  45.65 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.94 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  40.45 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.01 
 
 
136 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.22 
 
 
381 aa  61.6  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.66 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 
531 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  38.78 
 
 
504 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.27 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
526 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.44 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.27 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
182 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  33.7 
 
 
181 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.52 
 
 
182 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.76 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.13 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  31.58 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  36.26 
 
 
159 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.44 
 
 
122 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
104 aa  52  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  30.43 
 
 
182 aa  50.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  37.65 
 
 
508 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  37.65 
 
 
508 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 
513 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.65 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  37.65 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  37.65 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  30.43 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.65 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.65 
 
 
508 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.44 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.61 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  37.65 
 
 
508 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.65 
 
 
508 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.94 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.42 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
508 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1286  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.36 
 
 
104 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
644 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52 
 
 
269 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52 
 
 
269 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
227 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.98 
 
 
233 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29 
 
 
110 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.96 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  40.35 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 
435 aa  48.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
130 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21930  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  29.7 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.62 
 
 
210 aa  47.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  30.43 
 
 
181 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.74 
 
 
370 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  32.79 
 
 
102 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  31.62 
 
 
292 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 
203 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
508 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.18 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
508 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 
322 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 
513 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.53 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.18 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
512 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
508 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.86 
 
 
285 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
513 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.53 
 
 
130 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.48 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
95 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>