More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6043 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  100 
 
 
151 aa  296  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.68 
 
 
160 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.74 
 
 
161 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.89 
 
 
204 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.33 
 
 
207 aa  120  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.91 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  66.67 
 
 
192 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.03 
 
 
134 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  54.95 
 
 
141 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.75 
 
 
146 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.9 
 
 
141 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  45.86 
 
 
124 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.86 
 
 
124 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.86 
 
 
124 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.14 
 
 
138 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.47 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.94 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.59 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.76 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  47.25 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.91 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  46.94 
 
 
138 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.64 
 
 
128 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.09 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  39.73 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.4 
 
 
179 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  41.57 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  33.91 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.6 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.18 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.46 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.14 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.67 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  34.58 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.23 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  36.96 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
526 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.81 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  34.41 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.67 
 
 
182 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.26 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.78 
 
 
186 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.94 
 
 
227 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.73 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.28 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  33.71 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.56 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.37 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.9 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
513 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.29 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
508 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.37 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
531 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.63 
 
 
182 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
435 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
508 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
212 aa  53.9  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  28.97 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.34 
 
 
206 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.98 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  31.37 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  37.04 
 
 
508 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  37.04 
 
 
508 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.04 
 
 
508 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.04 
 
 
508 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  37.04 
 
 
508 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  37.04 
 
 
508 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.34 
 
 
647 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  35.54 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 
509 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.04 
 
 
508 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.76 
 
 
349 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  42.25 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.04 
 
 
508 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  37.04 
 
 
508 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  42.37 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.07 
 
 
349 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
513 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
233 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.53 
 
 
370 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
546 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.02 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.08 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
507 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.84 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  34.44 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  37.68 
 
 
203 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  42.37 
 
 
345 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
516 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.22 
 
 
513 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 
322 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>