More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1306 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
146 aa  277  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.05 
 
 
179 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.8 
 
 
381 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  44.94 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.02 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.42 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.73 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  43.94 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  36.11 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.94 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.65 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  41.74 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.74 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.74 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.27 
 
 
207 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.24 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.71 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.51 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  43.16 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  50.63 
 
 
513 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.2 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  48.48 
 
 
525 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.3 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.63 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  37.11 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
531 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.09 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.5 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.43 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  42.86 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  46.97 
 
 
525 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.62 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  41.76 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  35.48 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.04 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
508 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
513 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  39.51 
 
 
508 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.45 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  39.51 
 
 
508 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  43.3 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  34.78 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.08 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
521 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.27 
 
 
508 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  38.27 
 
 
508 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  38.27 
 
 
508 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  35.24 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.27 
 
 
508 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.82 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  38.27 
 
 
508 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  41.18 
 
 
292 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
435 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  38.14 
 
 
238 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.43 
 
 
186 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.67 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  37.04 
 
 
508 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  37.04 
 
 
508 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
499 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
504 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.32 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.65 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
508 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
482 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
524 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.66 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
604 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  43.43 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 
526 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
508 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.65 
 
 
206 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.35 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  49.33 
 
 
512 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.81 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 
592 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  34.34 
 
 
507 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.7 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  40 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.18 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  35.96 
 
 
504 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  39.18 
 
 
521 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.22 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
504 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 
513 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>