More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2392 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  50.49 
 
 		 105 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  48.04 
 
 		 105 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  48.39 
 
 		 111 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  48.45 
 
 		 105 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  47.31 
 
 		 111 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  50.5 
 
 		 106 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  45 
 
 		 102 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  40.2 
 
 		 102 aa  92.8  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  48.45 
 
 		 105 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  40.2 
 
 		 102 aa  92.8  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  45 
 
 		 102 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  45 
 
 		 138 aa  92  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 		 100 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  46 
 
 		 102 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  43.4 
 
 		 131 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  43.93 
 
 		 123 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  45.63 
 
 		 102 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  43.75 
 
 		 99 aa  89.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  45.1 
 
 		 108 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.33 
 
 		 99 aa  89.4  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  39.66 
 
 		 120 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.79 
 
 		 100 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  44.25 
 
 		 117 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  46.94 
 
 		 107 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  40.87 
 
 		 134 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  46.88 
 
 		 103 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 		 100 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  41.84 
 
 		 121 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  39.58 
 
 		 113 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.57 
 
 		 112 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  43.69 
 
 		 108 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  45.56 
 
 		 98 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  38.21 
 
 		 130 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  49.49 
 
 		 122 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  44 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  43.01 
 
 		 160 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  40.74 
 
 		 118 aa  86.3  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  43.88 
 
 		 106 aa  85.9  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  45.83 
 
 		 106 aa  85.5  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  42.7 
 
 		 99 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.79 
 
 		 101 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.36 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.38 
 
 		 109 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  40.62 
 
 		 119 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 113 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  37.06 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  43.3 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  41.41 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  38.21 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  42.57 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  38.21 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.16 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  33.6 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  39 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  43.75 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  44.09 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  48.31 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  42.59 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  41.76 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  34.92 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  44.9 
 
 		 136 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  39.58 
 
 		 101 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  41.75 
 
 		 100 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 		 126 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  48.86 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  40.95 
 
 		 107 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  45.45 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  40 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  45.74 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  43.01 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  42.39 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  35.96 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  40.82 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  40.86 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  47.25 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  51.14 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.75 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  41.05 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  40.62 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  45.16 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  41.18 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  38.54 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  46.15 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>