More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0562 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  202  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  88.24 
 
 		 102 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  88.24 
 
 		 102 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  58.76 
 
 		 113 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  57.73 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  56.57 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  55.45 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  55.45 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  53.47 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  53.92 
 
 		 104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  52.48 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  53.47 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  52.48 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  51 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  51.55 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  49.5 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  48.48 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  51.65 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  48.48 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  45.45 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  41.41 
 
 		 185 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  45.92 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  43.56 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  53.93 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  41.41 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  42.57 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  46.32 
 
 		 238 aa  87.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  41.67 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  43.88 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  44.79 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  41.41 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  42.16 
 
 		 185 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  39.58 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  39.8 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.62 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.79 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.71 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  41.76 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  45.24 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  38.54 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  35.35 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  38.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  41.18 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  39.39 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  39.39 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  37.76 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  38.83 
 
 		 189 aa  80.1  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  40.66 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  36.46 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  38.54 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  45.88 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.19 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  37.89 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  38.14 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  37.11 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  37.11 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  36.46 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  39.6 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  40.43 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  39.39 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  38.14 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  45 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  37.62 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  41.41 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  34.65 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  37.86 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  41.86 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  37.37 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  33.68 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  42.39 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  36.36 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>