More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5887 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  66.67 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  55.79 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  57.89 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  56.84 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  56.84 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  57 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  56.84 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  57.45 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  57.45 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  55.45 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  56.84 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  58.51 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  53.61 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  55.79 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  54.46 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  56.25 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  54.74 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  55.79 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  51.58 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  57.29 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  54.74 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  54.74 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  48.96 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  45.3 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  52.08 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  51.58 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  47.9 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  48.65 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  106  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  55.21 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  52.63 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  50.54 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  53.12 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  45.54 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  50.94 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  57.89 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  49.46 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  43.14 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  50.91 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  49.02 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  50.51 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  55.56 
 
 		 187 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  56.99 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  46 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  47.31 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  46.67 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  51.06 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  47.96 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  53.54 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  53.54 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  45.76 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  48 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  45 
 
 		 182 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  45.76 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  45.76 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  45.76 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  45.76 
 
 		 182 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  51.61 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  45.76 
 
 		 182 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  44.14 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  50.51 
 
 		 176 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  48.57 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  50.51 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  48.48 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  50.52 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  50.51 
 
 		 185 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  49.49 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  46.39 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  46.67 
 
 		 183 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  45.56 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  47.37 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  49.46 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  49.02 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  45.36 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  39.17 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  38.98 
 
 		 183 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  42.24 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  51.55 
 
 		 187 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  48.45 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  40.52 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  48.45 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.94 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  47.78 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  47.47 
 
 		 180 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  47.31 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 		 238 aa  84  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  47.47 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  41.82 
 
 		 166 aa  83.6  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>