More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1966 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  270  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  76.23 
 
 
121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  66.94 
 
 
117 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  71.43 
 
 
111 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  69.57 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  65.32 
 
 
143 aa  150  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  64.17 
 
 
122 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  68.81 
 
 
123 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  64.04 
 
 
122 aa  147  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  65.55 
 
 
117 aa  146  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  59.85 
 
 
134 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  66.04 
 
 
109 aa  143  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  65.42 
 
 
120 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  66.96 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  66.96 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  66.96 
 
 
112 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  60 
 
 
121 aa  143  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  70.09 
 
 
140 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  64.04 
 
 
149 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  66.67 
 
 
108 aa  142  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  62.07 
 
 
117 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  70.19 
 
 
115 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  70.19 
 
 
115 aa  141  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  65.45 
 
 
129 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  61.82 
 
 
110 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  67.31 
 
 
107 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  69.81 
 
 
138 aa  140  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  67.62 
 
 
103 aa  140  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  64.81 
 
 
142 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  62.39 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  60.48 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  61.95 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  63.3 
 
 
131 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  60.58 
 
 
110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  58.25 
 
 
108 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  58.65 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  51.28 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  54.29 
 
 
197 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  51.46 
 
 
118 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  46.73 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  45.79 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.08 
 
 
107 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  41.05 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 
238 aa  80.9  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  41.05 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  42.45 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.68 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  47.62 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  36.89 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  41.18 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.2 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  42.11 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  40.95 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  43.16 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.42 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  42.11 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  37.07 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  41.28 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  36.54 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  39.39 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  41.18 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.05 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  38.61 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  33.66 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  41.24 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  37.89 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  34.62 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  33.06 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  40.21 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  34.62 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  33.94 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.02 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  33.03 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  38.38 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  33.06 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  32.69 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  37.37 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  35.24 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  33.61 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  35 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>