More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4281 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  56.6 
 
 
106 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  54.74 
 
 
97 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  52.08 
 
 
105 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  48.51 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  48.51 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  44.55 
 
 
111 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  47.92 
 
 
100 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  47.47 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  43.56 
 
 
111 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  45.74 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  45.74 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  40.21 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  41.24 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 
238 aa  84.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  41.24 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  43.43 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  40.21 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  40.21 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  47.78 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  42.27 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  48.96 
 
 
107 aa  84.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  41.35 
 
 
120 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  41.35 
 
 
120 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  40.38 
 
 
120 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42.42 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  39.18 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  43.43 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  45.05 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.43 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  41.41 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  44.21 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  41.18 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40.38 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  43.16 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  42.71 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  41.94 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  42.42 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  37.37 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  42.27 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  38.95 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  43.01 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  45.92 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  37.37 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  38.54 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  39 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  42.42 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  40.22 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  40.59 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  37.11 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  39.18 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  41.35 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  41.49 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  43.16 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  44 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  38.14 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  38.14 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.89 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  39 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  39 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.25 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  35.35 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  36 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  34.21 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  40 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  39.42 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  42.27 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  39.22 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>