More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0255 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  63.37 
 
 
105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  53.66 
 
 
97 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  44.55 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  48.51 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  48.72 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  41.84 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  47.06 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  44.94 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  39.8 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  45.88 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  40.21 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  37 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  47.78 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  44.05 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  43.53 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.35 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  37.89 
 
 
101 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  40.7 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  41.94 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  40.91 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  45.57 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  47.56 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  41.46 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  36.89 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  46.34 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  40.86 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  37.21 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  42.68 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  43.42 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  42.68 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  37.36 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  41.57 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  44.09 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  40.45 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  36.08 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  39.78 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  36.78 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  36.08 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  38.04 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  40.96 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.17 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  38.64 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  35.05 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  35.05 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  42.68 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  42.68 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  41.46 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  36.36 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  39.76 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  41.77 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  40.48 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.35 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  39.08 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  41.46 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  40.23 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  31.68 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  39.78 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  40.91 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  37.86 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  38.89 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.04 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  37.78 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  35.96 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  38.64 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  35.96 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  35.63 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.03 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  39.78 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  41 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  34.44 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  34.09 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  41.38 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  34.09 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  37.21 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  34.29 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>