More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3279 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  100 
 
 
185 aa  359  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  51.61 
 
 
120 aa  131  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  52.42 
 
 
120 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  59.18 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  57 
 
 
111 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  56 
 
 
111 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  56 
 
 
120 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  55.88 
 
 
119 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  56.86 
 
 
131 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  58.65 
 
 
117 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  53.85 
 
 
130 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  57.84 
 
 
123 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  55.34 
 
 
108 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 
139 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  48.55 
 
 
139 aa  121  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  48.55 
 
 
139 aa  121  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  56.12 
 
 
120 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  56.86 
 
 
127 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  56.12 
 
 
120 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  48.44 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  53.54 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  54.55 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  53.15 
 
 
119 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  55.56 
 
 
105 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  55.66 
 
 
113 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  56.7 
 
 
154 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  55.88 
 
 
138 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  56.12 
 
 
120 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  51.49 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  52.94 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  50.96 
 
 
126 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 
126 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 
127 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 
127 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  56.12 
 
 
156 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 
127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  52.94 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  52.94 
 
 
126 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  52.53 
 
 
103 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  48.08 
 
 
104 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  45.71 
 
 
108 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  52.88 
 
 
123 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  52.88 
 
 
122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  51.52 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  52.88 
 
 
122 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  52.08 
 
 
120 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  48.04 
 
 
108 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  51 
 
 
128 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  50.91 
 
 
121 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  45.19 
 
 
135 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
133 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  53.33 
 
 
126 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  52.08 
 
 
130 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  45.05 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  46.81 
 
 
105 aa  99  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 
122 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  50.96 
 
 
123 aa  98.6  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  47.92 
 
 
130 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  44.35 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  47.06 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.22 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  39.35 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  35.83 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  43.88 
 
 
100 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  45.79 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.41 
 
 
102 aa  92  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  41.3 
 
 
119 aa  91.7  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
100 aa  91.3  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  52.63 
 
 
126 aa  91.3  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  39.18 
 
 
110 aa  90.9  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  41.24 
 
 
110 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  50 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.9 
 
 
133 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  52.17 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  50 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  42 
 
 
104 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  39.39 
 
 
102 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  39.39 
 
 
102 aa  88.2  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  43.3 
 
 
113 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  34.16 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  44.09 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  44.32 
 
 
102 aa  85.5  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  37 
 
 
106 aa  85.5  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  42.16 
 
 
142 aa  85.1  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  42.72 
 
 
108 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
99 aa  85.1  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40.59 
 
 
121 aa  85.5  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41 
 
 
105 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  84.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>