More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0766 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  75 
 
 		 120 aa  191  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  75 
 
 		 120 aa  190  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  72.5 
 
 		 120 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  74.11 
 
 		 119 aa  184  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  69.17 
 
 		 120 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  69.17 
 
 		 120 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  55.96 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  56 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  57.43 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  55.14 
 
 		 160 aa  120  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  54.29 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  56.86 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  53.98 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  47.11 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  49.57 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  56.44 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  58.59 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  53.85 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  49.57 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  54.72 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  56.12 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  53.85 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  58.06 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  58.1 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  53.85 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  58.95 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  51.89 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  51.85 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  50.5 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  51.24 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  57.89 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  57.89 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  56.12 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  53.06 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  48.51 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  50 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  53 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  54 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  47.93 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  48.6 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  47.93 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  51.04 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  53.19 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  51.92 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  55.21 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  54.17 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  44.92 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  55.21 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  50.53 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  52.75 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  50 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  51.58 
 
 		 99 aa  95.9  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  47.22 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.58 
 
 		 212 aa  93.6  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  52.58 
 
 		 177 aa  93.6  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.88 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  41.59 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  49.48 
 
 		 178 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.16 
 
 		 100 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  53.76 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  41.41 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  42.15 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  52.69 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  47.92 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  42.48 
 
 		 216 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  43.3 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  48.48 
 
 		 187 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  40.87 
 
 		 183 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  42.34 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  42.48 
 
 		 216 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  47.31 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  46.46 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  44.23 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  45 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  43.96 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  46.39 
 
 		 176 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 		 99 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  45.57 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  43.43 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  43.43 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  36.19 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  37.11 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  47.25 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  44.94 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  40.35 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>