More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4461 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  97.64 
 
 		 127 aa  229  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  97.64 
 
 		 127 aa  229  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  85.83 
 
 		 127 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  81.15 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  85.32 
 
 		 117 aa  194  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  74.55 
 
 		 131 aa  169  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  68.33 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  68.33 
 
 		 139 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  66.39 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  66.67 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  71.3 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  71.43 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  71.43 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  70.48 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  70.48 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  57.6 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  64.55 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  66.12 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  62.5 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  61.61 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  60 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  54.07 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  57.8 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  58.62 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  55.17 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  63.39 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  59.29 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  57.28 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  61.05 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  53.51 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  59.63 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  56.41 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  60 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  60 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  59.38 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  53.98 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  54.81 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  60 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  59.14 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  56.84 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  57.89 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  52.21 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  54.9 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  56.7 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  56.25 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  50.51 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  51.58 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  48.42 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  48.96 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  46.53 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  48.48 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  46.94 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  43.41 
 
 		 185 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  43.41 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  52.69 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.9 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  52.69 
 
 		 182 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  50.52 
 
 		 182 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  50.52 
 
 		 174 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  50.52 
 
 		 182 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  50.52 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  47.79 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  50.52 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  50.52 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  50.52 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  45 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  47.83 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  46.74 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  44.68 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  49.46 
 
 		 185 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  49.46 
 
 		 185 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  47.19 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  42.42 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  42.72 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  45.88 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  45.65 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  44.68 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.32 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  47.06 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.68 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  39.2 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  44.09 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  42.45 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  39.09 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  41.84 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  38.95 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  38.95 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>