267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1972 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  74.86 
 
 		 183 aa  275  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  60.11 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  58.52 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  56.83 
 
 		 216 aa  229  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  56.28 
 
 		 216 aa  227  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  58.43 
 
 		 166 aa  213  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  51.69 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  49.72 
 
 		 189 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  45.25 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  48.59 
 
 		 181 aa  170  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  47.83 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  47.28 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  45.51 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  47.22 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  45.51 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.89 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  46.82 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.33 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  44.57 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  45.4 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  47.75 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  47.75 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  46.33 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  41.11 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  41.9 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  43.35 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  45.6 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  45.6 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  44.51 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  45.3 
 
 		 120 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  47.17 
 
 		 105 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  46.67 
 
 		 113 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  45.16 
 
 		 113 aa  90.9  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  47.96 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  43 
 
 		 99 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  36.5 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.72 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  40.98 
 
 		 119 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 		 107 aa  87  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  35.77 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  85.5  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  41.59 
 
 		 120 aa  84.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  84.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  41.59 
 
 		 120 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40.16 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  40.74 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  43.33 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  40.71 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  45.65 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  40.71 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  38.33 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  43.62 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40.8 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  41.59 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  40.57 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  47.83 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  42.73 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  45.16 
 
 		 117 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  39.68 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  41.51 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  42.45 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  44.57 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  44.57 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.57 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  43.81 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  39.6 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  41.51 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  43.48 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  41.9 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  43.62 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  37.76 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  41.35 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  40.54 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  38.05 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  44.57 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  39.58 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  40.34 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  37.14 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  38.61 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  39 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  39 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  39 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  39 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>