More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1270 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  51.91 
 
 
183 aa  178  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  49.45 
 
 
180 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  51.69 
 
 
183 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  51.69 
 
 
183 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  49.43 
 
 
177 aa  167  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  50 
 
 
185 aa  166  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  51.12 
 
 
181 aa  164  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  50.55 
 
 
182 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  47.28 
 
 
183 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  53.07 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  47.25 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  53.07 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  48.3 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  47.83 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  51.11 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  51.96 
 
 
185 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  50.56 
 
 
182 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  51.96 
 
 
185 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  50.56 
 
 
182 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  47.85 
 
 
189 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  50.56 
 
 
182 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  47.28 
 
 
216 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  52.25 
 
 
185 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  51.45 
 
 
178 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  51.69 
 
 
187 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  51.79 
 
 
166 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  50 
 
 
174 aa  154  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  49.19 
 
 
182 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  46.59 
 
 
181 aa  152  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  43.78 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  43.33 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  45.2 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  49.06 
 
 
104 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  46.6 
 
 
105 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  48.11 
 
 
108 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  45.37 
 
 
107 aa  99  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  48.54 
 
 
105 aa  97.8  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  54.9 
 
 
128 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  45.05 
 
 
107 aa  95.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  43.86 
 
 
111 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  42.98 
 
 
111 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  45.13 
 
 
120 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  45.13 
 
 
120 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  43.36 
 
 
120 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  48.57 
 
 
120 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  92.8  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
99 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  41.59 
 
 
120 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  46.02 
 
 
119 aa  91.3  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  44.34 
 
 
108 aa  90.9  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  44.25 
 
 
120 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  41.59 
 
 
120 aa  89.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  43.27 
 
 
113 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  49 
 
 
99 aa  88.6  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  42.31 
 
 
112 aa  87.8  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  46.53 
 
 
121 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  37.88 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  45.54 
 
 
154 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  47.47 
 
 
99 aa  85.1  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  40.38 
 
 
133 aa  85.1  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  45.74 
 
 
113 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  44.55 
 
 
118 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  45.54 
 
 
107 aa  84.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.67 
 
 
102 aa  84.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  46.81 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  40.54 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  51.09 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  47.87 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  39.67 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  41.59 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  41.12 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  44.79 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  48.91 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  42.45 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  41.12 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  43.93 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  39.42 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  46.39 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  47.83 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  41.67 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  47.83 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  43.56 
 
 
112 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  44.55 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  45.26 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  44.09 
 
 
127 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  45.16 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  77.4  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  38.89 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  37.96 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  42.02 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>