More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2836 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  87.8 
 
 		 122 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  84.55 
 
 		 122 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  88.62 
 
 		 122 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  81.3 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  80.95 
 
 		 126 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  65.04 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  68.47 
 
 		 117 aa  156  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  62.5 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  63.71 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  67.29 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  63.64 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  65.14 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  65.74 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  55.74 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  55.74 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  55.08 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  60.55 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  60.55 
 
 		 126 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  63.11 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  63.11 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  63.11 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  55.96 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  57.8 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  55.96 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  57.41 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  58.33 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  54.63 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  55.56 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  59.14 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  49.57 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  59.14 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  51.46 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  50.49 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  57.89 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  59.14 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  48.28 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  54.08 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  49.02 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  48.94 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  49.5 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  49.46 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  45.22 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  47.47 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  46.94 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  50.54 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  46.46 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  48.45 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  48.45 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  45.1 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  43.1 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  45.26 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  45 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  44.9 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  43.56 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  43.27 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  37.93 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  40.2 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  42.16 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  43.82 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  41.23 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  49.46 
 
 		 187 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43.14 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  41.57 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 		 107 aa  83.6  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  40.95 
 
 		 106 aa  83.6  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  43.14 
 
 		 200 aa  84  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40.82 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40.82 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  44.94 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  44.94 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  46.51 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  43.16 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  46.94 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  43.43 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  42.62 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  42.62 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  36.94 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  43.68 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  42.62 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  44.33 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  41.51 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.68 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  43.48 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  42.39 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  43.3 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  43.3 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>