More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2460 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  95.9 
 
 		 122 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  84.55 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  94.26 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  83.74 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  78.57 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  77.78 
 
 		 126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  61.67 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  64.46 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  67.29 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  63.11 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  61.79 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  61.82 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  62.96 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  62.96 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  58.18 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  60.19 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  58.18 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  64.08 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  57.27 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  60.19 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  62.14 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  62.14 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  58.33 
 
 		 138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  56.48 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  56.48 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  56.48 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  55.56 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  51.69 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  54.63 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  52.68 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  57.94 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  55.91 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  56.99 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  55.1 
 
 		 113 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  47.93 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  52.88 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  58.06 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  54 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  47.57 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  51.06 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  46.6 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  48.04 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  48.45 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  48.48 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  47.31 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  46.94 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  49.46 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  46.46 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  46.46 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  45.1 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  43.88 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  43.16 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  44.21 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  41.18 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  48.04 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  47.78 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  44.94 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43.14 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  38.74 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  46.59 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  41.44 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  44.83 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.35 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  43.82 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  41.57 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  42.57 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  42.74 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  44.94 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  44.94 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  46.51 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  49.46 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.2 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  47.25 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  41.94 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  46.24 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  45.36 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  45.36 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  45.36 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  45.36 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  45.36 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  45.36 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.68 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  45.36 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  43.48 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  45.05 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  45.36 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>