More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0102 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  66.92 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  61.21 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  61.11 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  60.19 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  50.77 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  51.91 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  48.84 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  48.84 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  59.6 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  49.23 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  59.6 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  59.6 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  48.06 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  48.85 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  54.63 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  55.56 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  49.55 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  49.55 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  50.93 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  52.78 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  53.7 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  53.7 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  52.83 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  56.57 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  55.56 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  52.63 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  54.63 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  45.3 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  47.92 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  53.7 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  55.56 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  46.81 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  46.81 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  49.45 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  52.75 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  47.87 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  49.46 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  48.94 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  43.69 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  45.74 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  43.56 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  47.31 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  42.72 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  47.31 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  51.65 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  48.35 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  50.55 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  45.74 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  44.68 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  44.68 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  43.16 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  40.4 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  44.57 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  43.48 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.32 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  46.15 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  41.94 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  40.22 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  41.3 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  40.86 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  39.56 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  43.01 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  38.71 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  44.32 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.58 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  39.58 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  41.76 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  43.3 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  39.58 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  39.22 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  33.04 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  39.58 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  41.57 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  41.57 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  39.36 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  40.21 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  40.21 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  40.21 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  39.56 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  40.21 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  39.56 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  40.21 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>