More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01362 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  70.86 
 
 
176 aa  257  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  65.34 
 
 
178 aa  248  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  51.12 
 
 
180 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  49.72 
 
 
183 aa  174  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  49.43 
 
 
182 aa  167  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  49.43 
 
 
216 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  49.43 
 
 
216 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  48.86 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  46.67 
 
 
183 aa  163  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  46.59 
 
 
183 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  47.19 
 
 
180 aa  154  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  47.19 
 
 
180 aa  154  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  45.45 
 
 
181 aa  154  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  48.19 
 
 
166 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  43.78 
 
 
185 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  43.78 
 
 
185 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  42.7 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  42.94 
 
 
185 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  42.94 
 
 
185 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  43.18 
 
 
189 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  43.09 
 
 
181 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  44.69 
 
 
187 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  41.14 
 
 
179 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.75 
 
 
182 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  41.28 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  44.75 
 
 
182 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  44.75 
 
 
182 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  42.44 
 
 
179 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  44.75 
 
 
182 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.75 
 
 
182 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  44.75 
 
 
182 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  38.67 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  45.98 
 
 
174 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  41.9 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  47.57 
 
 
104 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  52.58 
 
 
120 aa  93.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  45.83 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.45 
 
 
99 aa  93.2  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  50.52 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  92.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  52.17 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  43.12 
 
 
111 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  48.48 
 
 
120 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  43.12 
 
 
111 aa  92  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  47.92 
 
 
113 aa  92  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  46.94 
 
 
128 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  45.79 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  50.55 
 
 
131 aa  91.3  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
99 aa  90.9  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  43.69 
 
 
107 aa  90.5  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 
105 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  46.94 
 
 
120 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  45.74 
 
 
113 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  46 
 
 
121 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  47.06 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  46.88 
 
 
119 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  47.92 
 
 
119 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  48.91 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  43.1 
 
 
126 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  48.91 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  44.33 
 
 
112 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  48.91 
 
 
126 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  42.74 
 
 
123 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  47.83 
 
 
139 aa  85.9  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  48.91 
 
 
117 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  43 
 
 
108 aa  85.5  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  85.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  43.3 
 
 
107 aa  85.1  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
126 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  47.83 
 
 
127 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  46.74 
 
 
124 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  84.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  42.74 
 
 
122 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  39.34 
 
 
132 aa  84.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  42.31 
 
 
105 aa  84.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  42.74 
 
 
122 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  39.05 
 
 
108 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.42 
 
 
112 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  44.57 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  46.74 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  39.42 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  45.65 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  48.91 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  46.24 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  46.24 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  41.41 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  40.66 
 
 
102 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42.16 
 
 
102 aa  80.5  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  45.26 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  40.19 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  43.3 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  44.57 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>