More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2033 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  100 
 
 
101 aa  199  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  54.55 
 
 
106 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  53.06 
 
 
113 aa  110  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  53.06 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  53.54 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  50.52 
 
 
110 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  49.5 
 
 
102 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  50.5 
 
 
200 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  47.31 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  42.42 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  40.43 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  40.43 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  40.62 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  37.76 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  41.94 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  43.3 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  44.68 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  41.49 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  42 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  40.43 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  42.11 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  38.83 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  40.4 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  40.43 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  41.75 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  43.62 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.75 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  38.04 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  37 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  41.76 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  39.39 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  38.38 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.39 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.17 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  39.36 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  39.36 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  37.76 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  35.42 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  45.16 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40.43 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  41.3 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  41 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  42.39 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40.43 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  41.49 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  36.63 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  39.8 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  41.3 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  41.3 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  37.63 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  37.23 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  40.86 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  38.37 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  41.41 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.39 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  33.71 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.66 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  38 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  33.65 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  38.89 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  38.3 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  36 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  38.89 
 
 
323 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  38.46 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  39 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  38.61 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  40.43 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>