More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0795 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  208  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  58.76 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  58.95 
 
 
98 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  54.17 
 
 
96 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  48.42 
 
 
93 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  48.42 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  39.33 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  37.89 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  34.74 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  33.68 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  37.37 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  30.53 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  36.59 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  36.59 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  32.63 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  34.07 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  31.58 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  36.96 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  34.02 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  33.71 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  37.35 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  29.9 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  30.53 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  37.76 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  35.05 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  36 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.12 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  31.91 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  30.61 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  35.37 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  35.37 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  34.69 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  31.25 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  33.98 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  35.48 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  32.98 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  32.29 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  31.18 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  31.91 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.79 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  29.47 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  36.78 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.29 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  33.98 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  32.98 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  36.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  36.11 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  38.83 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  30.85 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  36.56 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  33.65 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  36.14 
 
 
323 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  34.41 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  32.61 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  29.03 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  31.4 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  34.21 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  30.11 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  29.17 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  31.46 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.94 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.74 
 
 
200 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  31.46 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  31.46 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  29.7 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  34.09 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  33.33 
 
 
197 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  29.9 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  32 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  38.16 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  32.98 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  34.09 
 
 
164 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>