More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3948 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  59.6 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  53.54 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  54.74 
 
 		 96 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  45.63 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.45 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  45 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  45.79 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  43.69 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  44.34 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  44.79 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  45.92 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  44.9 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  39.45 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  48.35 
 
 		 238 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  38.95 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  42.22 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  38.95 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  45.05 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  41.05 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  43.16 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  48.24 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  45.05 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  39.25 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  37.89 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  38.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  41.94 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.57 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  37.89 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  41.3 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  41.57 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  42.55 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  48.45 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  36.27 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.6 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  42.86 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  36.27 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40.87 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  42 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  34.91 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.05 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  43.69 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  41.51 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  38.54 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  38.61 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  37.89 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  44.21 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  44.9 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  44.21 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  41.58 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  40.95 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  42.55 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  41 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  41 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  38.24 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  36.84 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  40.59 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  41.49 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  41.94 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  41.05 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  44.94 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  41.94 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  45 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  39.33 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  41 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  39.6 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  39.22 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  39 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  39.22 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  38.61 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>