More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1484 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  48.45 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  53.33 
 
 
133 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  52.22 
 
 
96 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  52.22 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  51.06 
 
 
100 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  51.11 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  49.04 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  48.39 
 
 
100 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 
99 aa  98.2  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  46.24 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  45.54 
 
 
109 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  46.39 
 
 
118 aa  94  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  44.86 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  42.42 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  43.62 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  42.71 
 
 
104 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  43.88 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  40.78 
 
 
212 aa  88.6  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  43.88 
 
 
111 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.19 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  46.46 
 
 
111 aa  87  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  38.14 
 
 
102 aa  87  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  42.11 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  37.37 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.67 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  39.42 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  40.37 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  44.9 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  44.09 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  40.62 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  39.6 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  42.86 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  38.46 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  37.76 
 
 
113 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
99 aa  84  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  39.58 
 
 
105 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  42.71 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  41.67 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  43.3 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42.71 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  44.79 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  41.84 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  40.38 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  43.3 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.86 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  40.82 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  42.27 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  40.37 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  40.82 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  42.27 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  41.24 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  43.3 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  42.45 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  42 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  41.05 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  39.39 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  43.01 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  40.43 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  35.96 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  41.24 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  37.96 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.71 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  40.59 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  37.14 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  36.89 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  39.42 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  40.86 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  36.61 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  34.91 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  41.05 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.27 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  43.18 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  42.42 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  40.38 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>