More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1459 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  56.6 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  59.04 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  53.33 
 
 		 238 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  43.27 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  46.74 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  42.99 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.08 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  46.67 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  46.74 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  46.81 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42.57 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  43.56 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 		 96 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  43.56 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  41.49 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  44.57 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 		 99 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  45 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  40.95 
 
 		 123 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  45.65 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  43.27 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  44.57 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  41.58 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.32 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  39.39 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  44.23 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  43.48 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  38.24 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  40.66 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  39 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  36.54 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  40.59 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  39.05 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  39.6 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  40.38 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  41.49 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  41.05 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  37.62 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  44.33 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  46.81 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  44.83 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  43.3 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.24 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.2 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  40.21 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  37.74 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  39.33 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.45 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  40.86 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  40.45 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  39.33 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  40.22 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  42.72 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  34.31 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  38.24 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  41.82 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  36.67 
 
 		 101 aa  76.6  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  40.43 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  43.48 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  43.56 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.81 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.89 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>