More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1571 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  216  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  94.29 
 
 
105 aa  207  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  77.14 
 
 
105 aa  176  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  65.71 
 
 
105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  53.85 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  48.54 
 
 
103 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  50.51 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  48.45 
 
 
238 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  47.57 
 
 
100 aa  94.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  47.62 
 
 
181 aa  93.6  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  46.53 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  46.94 
 
 
96 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  44.23 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  41.9 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  41.35 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  43.81 
 
 
179 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  43.93 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  45.63 
 
 
105 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  43.88 
 
 
113 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  44.23 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  45.54 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  44.79 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  44.79 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  44.23 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  43.88 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  42.16 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  45.63 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.71 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  44.23 
 
 
187 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  42.06 
 
 
180 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  43 
 
 
106 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  41.35 
 
 
185 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  39.42 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  44.55 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  42.42 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.58 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  42.57 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  39.42 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  41.9 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  42.57 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  42.31 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40.95 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  39.8 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  44.33 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  40.59 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  43 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  41.9 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  44.12 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  44.12 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  44.12 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.74 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  43.3 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  45.05 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  39.25 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  42.45 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  41.67 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  41.58 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  40.95 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  40.95 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  39.6 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  40.78 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.76 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  40.78 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  37.38 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.81 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  42.31 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  41 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  39.42 
 
 
178 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  42.71 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  39.8 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  40.95 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  42 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  40.95 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  37.14 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  41.9 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  34.95 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  38.24 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  41.24 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  40.95 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  37.86 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40.82 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>