More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0960 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  79.44 
 
 		 113 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  74.77 
 
 		 121 aa  172  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  57.73 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  55.1 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  55.1 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  55 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  50 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  53 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.04 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  52.04 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  53.06 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  45.28 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  44.23 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  41.18 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  41.24 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  42.59 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  42.16 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  47.19 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  38.78 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  40.2 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  39.36 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  42.86 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  47.52 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  39.22 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  39.6 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  39.6 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  36.27 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.71 
 
 		 106 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  39.25 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  38.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  38.61 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  38.38 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 		 100 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.22 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  37.96 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  40.21 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  41.24 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  37.38 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  36.89 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  37.38 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.56 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  37.25 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40.38 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  40.91 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  37.25 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  45.88 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  41.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  42.55 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  38.78 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  39.77 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  38.61 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  37.37 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  40.86 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  41.94 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  41.18 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.95 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  36.61 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  35.51 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  42.72 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  37.62 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  41.24 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  40.91 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  39.22 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  38.38 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  38.54 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  38.78 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  36.84 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  38.54 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  35.35 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>