More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2556 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  69.57 
 
 
117 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  72.07 
 
 
123 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  70.94 
 
 
149 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  75.24 
 
 
129 aa  157  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  65.79 
 
 
121 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  72.12 
 
 
109 aa  157  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  72.12 
 
 
108 aa  156  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  74.04 
 
 
107 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  76 
 
 
143 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  69.81 
 
 
111 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  71.56 
 
 
134 aa  153  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  75.49 
 
 
140 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  65.29 
 
 
131 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  72.73 
 
 
122 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  62.81 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  73.53 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  75.25 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  73.47 
 
 
103 aa  150  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  70.48 
 
 
117 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  71.72 
 
 
120 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  69.52 
 
 
121 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  72.82 
 
 
110 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  64.04 
 
 
136 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  74.51 
 
 
115 aa  146  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  72.16 
 
 
117 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  69.37 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  65.18 
 
 
119 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  70.59 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  59.81 
 
 
110 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  70.59 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  70.59 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  62.73 
 
 
142 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  69.61 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  59.62 
 
 
108 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  62.38 
 
 
110 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  49.59 
 
 
197 aa  121  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  53.47 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  52 
 
 
118 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  48 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  49 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  50.52 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  48.51 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  44.57 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.1 
 
 
99 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  44.57 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  43.88 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  34.91 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  34.91 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  42.42 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  43.75 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  43.3 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.31 
 
 
212 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  41.82 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  37.61 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  45.83 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  42.22 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  45.74 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  37.76 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.61 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  37.78 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  42 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  39.39 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  43.43 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  41.3 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  43.43 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  38.3 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  37.89 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  39.39 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  37.63 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  37.23 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  42.27 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  37.93 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  44.57 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  39.6 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  34.34 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  36.84 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.86 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>