More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0896 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  53.54 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  55.1 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  50 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.53 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  51.55 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  49.49 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  49.49 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  47.96 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  48.48 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  50.52 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  45.36 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  45.36 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  40.78 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  48.94 
 
 		 99 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  48.42 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  46.88 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  46.88 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  43.3 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  38.78 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1565  hypothetical protein  34.34 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000508323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  45.56 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  44.79 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  38 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  38.32 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  41.57 
 
 		 212 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  39 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  43.16 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  43.82 
 
 		 323 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  42.61 
 
 		 187 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  43.43 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  43.18 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  43.18 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  35.71 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  42.55 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  38.61 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  48.42 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  39.09 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  41.94 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  42.45 
 
 		 185 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  40.86 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  42.45 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  39.33 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  41.84 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  43.3 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.54 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  40.57 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  36.9 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  41.94 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  39.33 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  41.05 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  42.7 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  37.23 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  38.14 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  39.8 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 		 96 aa  76.6  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  41 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.61 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  43 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  41.67 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  41.18 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.89 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  39.18 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>