More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1191 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  82 
 
 		 100 aa  173  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  46.46 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  45.63 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  47.96 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  46.6 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  45.1 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  45.1 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  47.37 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  45.16 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  44.79 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.39 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  39.8 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  45.98 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  44.09 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  45.92 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  46.46 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  41.57 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  41.76 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  47.19 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  42.71 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  43.82 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  43.82 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  41.94 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  42.7 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  42.7 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  43.82 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  41.05 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  40.86 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  40.4 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  38.95 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  41.57 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  40.2 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  39.8 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  39.33 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  43.33 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  43.43 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  44.71 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  41.57 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  40.59 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  41.05 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  38.78 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  38.38 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  41.57 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  36.56 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  41.41 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  40.45 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  31.37 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  38.71 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  39.8 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  36.17 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  38.37 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  38.71 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  38.37 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  38.38 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  37.37 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  39.8 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  38.54 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  38.2 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  38.71 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  38.95 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.45 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  41.58 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  36.17 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  37.76 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  38.78 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  39.58 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  37.63 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  37 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>