270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0707 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  100 
 
 
183 aa  376  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  81.97 
 
 
216 aa  314  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  81.42 
 
 
216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  84.34 
 
 
166 aa  290  7e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  65.03 
 
 
183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  60.99 
 
 
183 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  60.11 
 
 
183 aa  236  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  54.24 
 
 
189 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  55.37 
 
 
181 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  49.13 
 
 
187 aa  180  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  49.18 
 
 
185 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  49.18 
 
 
185 aa  177  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  46.96 
 
 
180 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  49.72 
 
 
177 aa  174  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  48.28 
 
 
178 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.11 
 
 
182 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  46.11 
 
 
182 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  46.11 
 
 
182 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  46.11 
 
 
182 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  47.28 
 
 
182 aa  164  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  45.81 
 
 
182 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  46.7 
 
 
181 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  50.55 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  51.1 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  51.1 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  45.81 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  46.51 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  43.93 
 
 
179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  50.55 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  45.66 
 
 
174 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  48.35 
 
 
185 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  50.55 
 
 
185 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  45.66 
 
 
179 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  43.33 
 
 
185 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  44.51 
 
 
182 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  51.65 
 
 
113 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  52.13 
 
 
105 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  47.17 
 
 
108 aa  94.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  47.96 
 
 
128 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  44.66 
 
 
105 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  49.06 
 
 
107 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  44.76 
 
 
113 aa  92.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
99 aa  91.3  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  47.12 
 
 
104 aa  89.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  41.74 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  45.83 
 
 
108 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  43.4 
 
 
107 aa  88.2  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40.57 
 
 
111 aa  87.4  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  47 
 
 
156 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  40.52 
 
 
120 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  40.87 
 
 
120 aa  85.5  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  47.52 
 
 
121 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  40.34 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  43.88 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  45.74 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  40.35 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  37.74 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  35.42 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  45 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  36.79 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  46.32 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  39.47 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  41.75 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  38.26 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  37.72 
 
 
119 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40 
 
 
117 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  39.09 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  41.94 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  40.57 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  41.82 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.21 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  38.52 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  42.42 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  41.94 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  43.27 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  45.26 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  40.91 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  41.94 
 
 
127 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  38 
 
 
99 aa  77  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  43.69 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  36.29 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  38.74 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  43.43 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  40.95 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  36.13 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>