275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4171 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  53.11 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  48.88 
 
 
179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  43.33 
 
 
183 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  45.65 
 
 
181 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  42.86 
 
 
189 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  43.65 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  43.33 
 
 
185 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  44.63 
 
 
216 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  148  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  43.09 
 
 
185 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  41.21 
 
 
180 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  44.44 
 
 
166 aa  147  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  44.63 
 
 
216 aa  147  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  43.78 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  40.11 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  45.16 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  45.16 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  43.32 
 
 
185 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  44.02 
 
 
187 aa  143  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  44.75 
 
 
185 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  40.56 
 
 
183 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  38.67 
 
 
177 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  38.38 
 
 
178 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  40.57 
 
 
179 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  38.33 
 
 
176 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.7 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  37.17 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  37.17 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  37.17 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  37.17 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  37.16 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.65 
 
 
182 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  47.42 
 
 
128 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  46.39 
 
 
105 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  40.78 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.72 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.6 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  39.42 
 
 
99 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  44.66 
 
 
105 aa  87.8  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  39.18 
 
 
104 aa  87.8  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  39.81 
 
 
164 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  46.46 
 
 
120 aa  85.1  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  84.7  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42.16 
 
 
102 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  38.83 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  36.45 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  38.83 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  37.86 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  44.44 
 
 
120 aa  82  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  38.83 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  39.81 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  37.86 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  37.74 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  39.25 
 
 
109 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  42.16 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
100 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  41.75 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  37.86 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  36.89 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  40.59 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  36.73 
 
 
133 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  42.45 
 
 
120 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  42.45 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  39.8 
 
 
142 aa  79  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  39.18 
 
 
108 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  42.45 
 
 
120 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  39.6 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  39.8 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  38.14 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  41.75 
 
 
130 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  36.79 
 
 
124 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  36.89 
 
 
108 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  37.38 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  37.38 
 
 
105 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  37.38 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  41.41 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  37.62 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  37.38 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  37.25 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  37.25 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  33.98 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  33.98 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  36.97 
 
 
118 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  33.01 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  34.09 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  38 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  32.85 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  39.05 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  42.16 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  42.16 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  39.81 
 
 
102 aa  72  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  37.37 
 
 
130 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  34.74 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>