More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2832 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  48.91 
 
 
101 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  39.56 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  44.09 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  37.23 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  38.14 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  39.56 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  34.69 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  31.63 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.21 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  39.36 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  32.65 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  37.36 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  38.71 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.36 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  37.63 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  35.16 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  39.18 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  36.7 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  37.76 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  36.08 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  37.76 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  39.13 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  41.49 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  44.21 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  36.67 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  33.68 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  42.11 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  37.76 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  41.24 
 
 
197 aa  70.5  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  37.08 
 
 
160 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  37.5 
 
 
181 aa  70.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  37.08 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  36.26 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  35.05 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  41.76 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4173  protein of unknown function DUF59  30.91 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  34.02 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  35.79 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  36.67 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  31.43 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  34.02 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  36.26 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  36.26 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  35.87 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  37.36 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  38.54 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  34.78 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.14 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4150  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  43.3 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  34.02 
 
 
124 aa  66.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3042  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  33 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  38.71 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  34.38 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  30.21 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  34.38 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.84 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  39.33 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  31.96 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  38 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3738  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.95 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188896  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  38.14 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  35.16 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  32.22 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  34.44 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2413  phenylacetate-CoA oxygenase PaaJ  33 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0756  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40.86 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  37.36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  37.63 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  32.29 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  35.05 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>