More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4173 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4173  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  38.68 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  46 
 
 
101 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  39.05 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  35.48 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  35.56 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  31.19 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  33.33 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  35 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  28.16 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2961  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.29 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  30.91 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  34.15 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  34.15 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.44 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3042  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.95 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  33 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1915  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.71 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.844425  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  33.68 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2413  phenylacetate-CoA oxygenase PaaJ  32.69 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  30.39 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  33.94 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  28.16 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  34.94 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  30.19 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  30.93 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  29.17 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  31.31 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  31.76 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  30.63 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  37.35 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2254  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  33.64 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.58 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  38 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  26.13 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3426  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0224942  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0307  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0405135  hitchhiker  0.00121913 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3727  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.29 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.784868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2779  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0246  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.89 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  31.82 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0327  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3156  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  31.4 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  31.58 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  32.43 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  33.01 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  33.73 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  32.43 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  30.08 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4807  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.91 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.553285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0255  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00867591  normal  0.026194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2264  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  32.73 
 
 
165 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91421  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  30.11 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  27.84 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1478  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  32.73 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  30.93 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  30.34 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  30.34 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1576  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  32.73 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  27.88 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  30.43 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2201  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  37.89 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0229  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.92 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000381219  hitchhiker  0.00114701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  31.46 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4286  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  31.68 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  32.63 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3275  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  33.33 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721479  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  30.43 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0931  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.91 
 
 
174 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0756  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40.43 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3821  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  35.29 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134466  normal  0.475873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0653  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  31.37 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  32.53 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  28.42 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  27.91 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3215  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  32.43 
 
 
189 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.667172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  27.06 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  30.85 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4469  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  41.11 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475576  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2484  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  32.29 
 
 
177 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.323944  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  31.87 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  31.87 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2860  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.08 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211249 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  27.5 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3075  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  30.61 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>