More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3876 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  50 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  48.88 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  45.66 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  47.4 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  46.82 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  43.33 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  42.53 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  46.39 
 
 		 166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  42.53 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  40.7 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  45.45 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  43.35 
 
 		 183 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  45.2 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  42.44 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  44.51 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  44.51 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  38.95 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  40.23 
 
 		 176 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  42.61 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  42.61 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  42.37 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  42.61 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  42.86 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  42.86 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  39.18 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  40.23 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  40.23 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  39.08 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  48.45 
 
 		 113 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  47.96 
 
 		 108 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  46.67 
 
 		 102 aa  92  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  42.57 
 
 		 99 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  43.81 
 
 		 105 aa  87.8  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  41.51 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  41.51 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  41.58 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  43.56 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  40.95 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  36.21 
 
 		 133 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  45.74 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  42.27 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  42.42 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  37.9 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  34.27 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  45.36 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  43.3 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  45.45 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  38.89 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  39.56 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  39 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  35.42 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  37.74 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  39.36 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  34.95 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  44.33 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  39.81 
 
 		 104 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  42.27 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  41.49 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  40.74 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  37.69 
 
 		 130 aa  72  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  37.76 
 
 		 144 aa  72  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.63 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  37.96 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  38.3 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  36.63 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  38.3 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  38.3 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  41.49 
 
 		 109 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40.2 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  38.3 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  39.25 
 
 		 105 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  38.3 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  44.33 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  40.46 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  40.46 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  36.63 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  40.21 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  36.63 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  34.34 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  39.18 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>