More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1842 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  100 
 
 
96 aa  193  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  74.74 
 
 
93 aa  147  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  71.88 
 
 
98 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  63.83 
 
 
99 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  50.53 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  54.17 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  51.58 
 
 
100 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  44.79 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  38.89 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  35.79 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  45.26 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  40.86 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  41.94 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  38.54 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  35.79 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.54 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  37.89 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  40.62 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  39.18 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  39.08 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  36.46 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  36.46 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  36.56 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  35.42 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  34.38 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  34.41 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  38.14 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  38.14 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  35.79 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  35.79 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  38.14 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  38.14 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  38.14 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  44.32 
 
 
160 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  35.79 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  32.63 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  39.18 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  37.89 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  33.68 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  36.84 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  36.84 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  35.48 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  36.84 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  35.87 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  38.3 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  34.38 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  44.05 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  38.54 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  34.74 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  34.74 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  34.38 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  34.38 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  38.71 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  38.71 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.11 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  37.37 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  34.38 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  34 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  36.56 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  37.63 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  33.68 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  38 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  33.68 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  36.46 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  35.05 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  33.33 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  35.42 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  32.29 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  34.69 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  32.29 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>