More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2291 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  49.41 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  48.31 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  48.98 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  43.27 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  41.94 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  37.63 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.48 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  37.63 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  41.94 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.96 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  45.92 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  46.94 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  45.57 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  44.3 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.48 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  42.05 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  39.18 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  38.78 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40.86 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  34.74 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  41.3 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  48.24 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  40.66 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  41.11 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  41.38 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.14 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  41.84 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  40.7 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  38.37 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  40.23 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  40.23 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  42.7 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.45 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  36.9 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  40.51 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  38.75 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  40.22 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  38.82 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  39.77 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  43.16 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  38.2 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  38.2 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.02 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.56 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  45.98 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  43.53 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.11 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  38.64 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  43.21 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41.98 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  37.93 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  38.64 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  38.61 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  33.67 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  44.57 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  39.08 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  37.63 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  36.08 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  38.14 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  37.08 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  35.96 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  39.02 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  42.05 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  34.09 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  37.78 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  37.08 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  41.67 
 
 		 323 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  42.35 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>