More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2594 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  72.22 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  67.48 
 
 
123 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  68.07 
 
 
117 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  70.37 
 
 
130 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  65.74 
 
 
138 aa  157  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  65.74 
 
 
131 aa  156  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  66.67 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  66.67 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  66.67 
 
 
127 aa  153  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  62.96 
 
 
139 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  62.96 
 
 
139 aa  150  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  61.11 
 
 
139 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  57.63 
 
 
124 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  62.96 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  60.19 
 
 
126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  60.19 
 
 
126 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  60.19 
 
 
126 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  52.54 
 
 
135 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  60.19 
 
 
130 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  58.33 
 
 
133 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  57.41 
 
 
122 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  57.41 
 
 
123 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  56.48 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  57.14 
 
 
120 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  59.18 
 
 
131 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  50.85 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  55.96 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  58.16 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  58.16 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  58.16 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  52.78 
 
 
130 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  52.1 
 
 
119 aa  124  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  58.33 
 
 
122 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  53.21 
 
 
120 aa  123  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  55.88 
 
 
185 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  55.17 
 
 
123 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  56.25 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  52 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  49.12 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  51 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  50.42 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  53.61 
 
 
120 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  54.64 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  56.25 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  49.18 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  54.17 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  52.78 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  52 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  48.45 
 
 
112 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  47.37 
 
 
156 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  46.15 
 
 
107 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  47.96 
 
 
105 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  47.62 
 
 
108 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  47.47 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  44.66 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  44.23 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  45.83 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  47.47 
 
 
187 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  47.47 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  46.53 
 
 
104 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  43.27 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  43.75 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  49.47 
 
 
185 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  49.48 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  49.48 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  45.36 
 
 
176 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  49.48 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  49.48 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  49.48 
 
 
174 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  44.04 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  49.48 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  49.47 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  49.48 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 
100 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  50.53 
 
 
182 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
99 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  38.33 
 
 
187 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  44.79 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 
100 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  47.78 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  46.88 
 
 
177 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  41.38 
 
 
183 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  46.07 
 
 
113 aa  87  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  45.24 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.83 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  39.8 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  44.33 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.05 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  44.44 
 
 
200 aa  84.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  45.74 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
238 aa  84  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  40.68 
 
 
185 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  40.48 
 
 
185 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  44.76 
 
 
183 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  38.05 
 
 
181 aa  83.6  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  43.81 
 
 
183 aa  83.6  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>