More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1895 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  100 
 
 
126 aa  253  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  98.41 
 
 
126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  86.51 
 
 
126 aa  228  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  86.51 
 
 
126 aa  227  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  87.04 
 
 
139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  87.04 
 
 
139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  82.88 
 
 
131 aa  193  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  84.26 
 
 
139 aa  193  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  72.8 
 
 
133 aa  168  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  67.29 
 
 
138 aa  161  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  73.33 
 
 
117 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  72.38 
 
 
123 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  73.33 
 
 
127 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  68.52 
 
 
130 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  71 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  71 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  70 
 
 
127 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  60.91 
 
 
124 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  60.19 
 
 
119 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  55.96 
 
 
123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  57.66 
 
 
130 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  57.94 
 
 
135 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  56.48 
 
 
122 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3970  hypothetical protein  56.3 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  55.56 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  63.92 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  53.7 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  57.84 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  60.82 
 
 
120 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  60.82 
 
 
120 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  49.55 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  60.82 
 
 
120 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  59.79 
 
 
113 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2746  FeS assembly SUF system protein  56.48 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  53.85 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  56.7 
 
 
120 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  54.74 
 
 
108 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  51.59 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1660  hypothetical protein  53.7 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886936  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2324  hypothetical protein  52.78 
 
 
126 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.312224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  52.94 
 
 
185 aa  114  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  55.21 
 
 
132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  53.61 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  54.08 
 
 
111 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  52.58 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  53.12 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  55.17 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  53.61 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  53.06 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  45.9 
 
 
160 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  54.17 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  54.74 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  52.58 
 
 
105 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  49.18 
 
 
156 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  47.52 
 
 
107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  52.04 
 
 
103 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  45.1 
 
 
105 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  47.37 
 
 
99 aa  101  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  51.55 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  48.42 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  47.78 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  47.31 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  48.45 
 
 
128 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  44.68 
 
 
100 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  44.79 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  49.48 
 
 
178 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  39.82 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  49.48 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  48.39 
 
 
185 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  48.39 
 
 
185 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  51.55 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  48.39 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  51.55 
 
 
174 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  51.55 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  45.71 
 
 
181 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  46.24 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  45.36 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  51.55 
 
 
182 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  47.73 
 
 
118 aa  84.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  41.24 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  50 
 
 
177 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  40.21 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  43.82 
 
 
212 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  44.79 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  42.27 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  38.24 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.61 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>