268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2708 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  98.35 
 
 
182 aa  358  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  97.8 
 
 
182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  97.8 
 
 
182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  97.8 
 
 
182 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  97.8 
 
 
182 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  97.7 
 
 
174 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  89.01 
 
 
182 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  60.87 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  60.33 
 
 
185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  50.55 
 
 
182 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  45.81 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  50.28 
 
 
183 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  45 
 
 
189 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  43.41 
 
 
180 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  47.88 
 
 
166 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  43.33 
 
 
183 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  48.09 
 
 
180 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  48.09 
 
 
180 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  45.25 
 
 
216 aa  151  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  44.69 
 
 
216 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  46.89 
 
 
183 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  46.07 
 
 
176 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  45.81 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  44.75 
 
 
177 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  45.4 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  44.07 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  39.31 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  46.45 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  45.36 
 
 
185 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  46.15 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  43.01 
 
 
187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  42.22 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  37.7 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.08 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  53.26 
 
 
113 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  45.76 
 
 
120 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  49.48 
 
 
164 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  47.57 
 
 
104 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  46.22 
 
 
185 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  50 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  43.55 
 
 
121 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  47.42 
 
 
107 aa  92  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  48.45 
 
 
108 aa  92  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  52.58 
 
 
131 aa  91.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  52.58 
 
 
127 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5844  FeS assembly SUF system protein  51.55 
 
 
123 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  47.42 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  46.08 
 
 
128 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  49.48 
 
 
119 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  45.92 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  50.52 
 
 
117 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  48.98 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  52.69 
 
 
127 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  48 
 
 
105 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  48.45 
 
 
130 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  42.71 
 
 
108 aa  88.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  46.39 
 
 
108 aa  87.8  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  49.48 
 
 
126 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  51.55 
 
 
126 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  51.61 
 
 
127 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  51.61 
 
 
127 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  49.48 
 
 
139 aa  85.5  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  49.48 
 
 
139 aa  85.5  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  51.55 
 
 
126 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  44.9 
 
 
154 aa  84.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  48.45 
 
 
139 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  41.35 
 
 
102 aa  84.3  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  42.27 
 
 
105 aa  84.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  44.33 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  44.12 
 
 
132 aa  84  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  49.48 
 
 
126 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.58 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  44 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  46.39 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  48.45 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  39.86 
 
 
135 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  45.92 
 
 
131 aa  82  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  41.51 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  39.05 
 
 
111 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  45.92 
 
 
102 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  44.33 
 
 
120 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1604  protein of unknown function DUF59  47.87 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  45.36 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  43.3 
 
 
123 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  44.33 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0814  FeS assembly SUF system protein  49.48 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0307026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  42.27 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  43.3 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  36.61 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  38.95 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  46.24 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  40.21 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  44.33 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  45.36 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  43.3 
 
 
120 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>