276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1503 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1503  aromatic ring hydroxylating enzyme  100 
 
 
179 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.18078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  46.33 
 
 
183 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  45.14 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  42.37 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0707  FeS assembly SUF system protein SufT  43.93 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.357748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  43.5 
 
 
183 aa  160  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  46.78 
 
 
180 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1972  hypothetical protein  44.63 
 
 
183 aa  158  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  45.4 
 
 
178 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0856  FeS assembly SUF system protein SufT  41.01 
 
 
216 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0974  hypothetical protein  41.01 
 
 
216 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.438965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2338  FeS assembly SUF system protein SufT  46.37 
 
 
185 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00501681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2849  hypothetical protein  46.37 
 
 
185 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  43.33 
 
 
181 aa  147  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04567  domain of unknown function protein  42.77 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1442  hypothetical cytosolic protein  44.44 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1509  hypothetical protein  44.44 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  42.2 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  42.13 
 
 
185 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  43.33 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0608  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2885  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2404  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2828  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  43.02 
 
 
181 aa  144  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2765  phenylacetic acid degradation protein paaD  46.37 
 
 
182 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  41.99 
 
 
187 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1717  hypothetical protein  47.4 
 
 
174 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  41.01 
 
 
185 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  41.14 
 
 
177 aa  140  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2708  phenylacetic acid degradation protein paaD  45.81 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  40.45 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  40.57 
 
 
185 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1792  hypothetical protein  43.58 
 
 
182 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.486527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.18 
 
 
179 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  45.83 
 
 
108 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 
105 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  41.82 
 
 
108 aa  92.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  45.74 
 
 
107 aa  90.9  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  37.8 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  42.34 
 
 
108 aa  90.5  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  46.74 
 
 
113 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  37.8 
 
 
120 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  37.8 
 
 
120 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  43.43 
 
 
107 aa  88.2  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  42.55 
 
 
104 aa  87  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  41.49 
 
 
112 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  45.74 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  38.74 
 
 
120 aa  84.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  40.83 
 
 
120 aa  84.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0162  FeS assembly SUF system protein  42.42 
 
 
103 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000779531  unclonable  7.25464e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  43.14 
 
 
99 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  40.4 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  42.42 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42.99 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  44.12 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  42.55 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.24 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  39.58 
 
 
113 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  39.56 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  43.01 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  40.4 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  41.94 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  37.1 
 
 
120 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  42.39 
 
 
126 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3314  FeS assembly SUF system protein  37.29 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0845905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  38.3 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
126 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  35.65 
 
 
120 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.4 
 
 
105 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  38.38 
 
 
105 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  41.3 
 
 
126 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  41.3 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  38.38 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  41.3 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  37.23 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  39.78 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  36.17 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  44.09 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40.86 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40.86 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  37.5 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  36.08 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  44.09 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  44.09 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.954909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>