More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1755 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  196  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4173  protein of unknown function DUF59  46 
 
 
131 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  48.91 
 
 
108 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  39.6 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  36.63 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  39.6 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2413  phenylacetate-CoA oxygenase PaaJ  36.89 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  39.36 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3042  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  39.22 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  39.81 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  40.43 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  42.42 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  41.38 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4807  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  47.06 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.553285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  39.6 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  30.61 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  46.43 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  38.61 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  39.39 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  37.62 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  39 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.78 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  41.77 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  38.82 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  39.74 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.81 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0931  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40.78 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  38.3 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  39 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  35.53 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  39.39 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0810  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  44.55 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  36.84 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  38.14 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2961  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.84 
 
 
176 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1546  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  37.11 
 
 
166 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  41.98 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  38.78 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  40.21 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  36.27 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  44.9 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  32.29 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1440  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.73 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  39.58 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  36.56 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  38.54 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0790  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.63 
 
 
163 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.12987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  36.96 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4564  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.583831 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  38.14 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3492  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.318396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  35.92 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  44.05 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  38.78 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  41.1 
 
 
365 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1915  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  36.36 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.844425  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  38.16 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  35 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1241  phenylacetate-CoA oxygenase PaaJ subunit  39.8 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2201  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  40.2 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124529  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  32.61 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  38.38 
 
 
163 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  37.23 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  38.38 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3738  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  37.76 
 
 
171 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.34 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  32.98 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  38.67 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  41.84 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  32.91 
 
 
314 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  38.67 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4150  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  41.18 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4286  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  37.89 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  31.07 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  36.9 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  39.76 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  32.29 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>