266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5673 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  253  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2106  protein of unknown function DUF59  66.92 
 
 
134 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.070916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6120  hypothetical protein  63.57 
 
 
136 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0673511  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  62.5 
 
 
131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.11 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  41.11 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  41.11 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  47.73 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  40.82 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  43.48 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  35.87 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.14 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  44.33 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  38.39 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.39 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.71 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  43.01 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.86 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  38.95 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  41.94 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  35.16 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  46.43 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  35.48 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  36.27 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.65 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  45.16 
 
 
103 aa  66.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.7 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  40.43 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  37.27 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  38.54 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  36.36 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  35.48 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  40.62 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  40.57 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2832  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  41.3 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.82 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  39.8 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  40.86 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  34.83 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  33.71 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  31.63 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.63 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  39.13 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  43.18 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  29.59 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  33.71 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  33.71 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  40.43 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  33.71 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  33.71 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  41.94 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  40.21 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  42.05 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  39.36 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  36.08 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  41 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  38.71 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  36.04 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  39.6 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  38.14 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  36.73 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  37.66 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  36.73 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  42.53 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  44.05 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  35.19 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  38.24 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  38.04 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.38 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  36.56 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  35.59 
 
 
157 aa  60.1  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  32.61 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  36.67 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  36.36 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  38 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>