213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6120 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6120  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  267  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0673511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2106  protein of unknown function DUF59  67.16 
 
 
134 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.070916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  63.57 
 
 
130 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  62.6 
 
 
131 aa  141  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  48.81 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  37.25 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  41.18 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  36.27 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  46.07 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  38.6 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  35.96 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  42.05 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  34.26 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  36.28 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  38.64 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  40.45 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  34.83 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.7 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  40.45 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  35.83 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  37.14 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  38.64 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  40.45 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  37.14 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  39.77 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.48 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  41.57 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  43.33 
 
 
238 aa  62.8  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.19 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40.45 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40.45 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  36.45 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  34.94 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  40.4 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  37.63 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.48 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  34.83 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  35.23 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.36 
 
 
179 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  33.7 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  37.62 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  37.61 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  38.83 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  37.86 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  39.53 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  36.46 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  39.33 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  36.36 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  34.86 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  37.21 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  37.21 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  38.24 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  34.41 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  39.36 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.5 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.63 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  41.38 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.63 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.63 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  35.19 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  32.26 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  37.37 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  34.57 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  32.18 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  36.56 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  36.47 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  37.21 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  35.16 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  38.37 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  37.78 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  34.69 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  35.35 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.78 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  37.21 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  35.71 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  34.04 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>