292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1486 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  48.39 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  43.75 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  43.75 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  44.09 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  43.69 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  39.78 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  36.19 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  39.78 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  38.89 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  34.74 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  36.56 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0398  hypothetical protein  34.41 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  34.41 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  41.24 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  36.56 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  34.29 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1272  hypothetical protein  32.61 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.025331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  31.52 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  39.36 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  38.3 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  39.13 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  36.89 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  37.11 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  40.22 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  38.3 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4256  hypothetical protein  37.38 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  40.86 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  38.3 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.87 
 
 		 197 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  36.96 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  33 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  33 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  31.96 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  34.02 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  39.13 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  34.41 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.73 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  35.79 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2608  hypothetical protein  36.96 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  31.18 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.61 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  38.64 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  41.51 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  37.76 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  31.96 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  33.66 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  30.34 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  32.67 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  29.59 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.11 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  32.22 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  32.35 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.62 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  39.56 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  32.71 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.23 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.95 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  37.04 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.96 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  28.43 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  28.12 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.74 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  34.65 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>